生信之旅

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nas 搭建个人书城

个人收集了部分电子书籍,但是一直没有进行整理,手头上又正好有一台组装好的nas,故打算用nas来搭建个人的书库,用于整理和阅读书籍。我使用的平台是calibre-web一、安装我使用docker来管理这些应用,我们可以使用别人做好的镜像来进行搭建,比较方便快捷。github和dockerhub上可以找到其对应的信息。在安装好docker的情况下,直接运行下诉命令来拉取镜像。......

Linux 配置ssh安全登录及登录提醒

SSH一、安装google-authenticatorapt-get install libpam-google-authenticator二、运行google-authenticatorgoogle-authenticator而后在输出信息中根据需求选择Y或者N即可三、配置ssh首先,需要修改/etc/pam.d/sshd文......

Linux终端下阅读Markdown文档

在日常工作中,我们时不时会遇到markdown文档,一般我们都是需要用特定的软件进行打开,在终端上一般都是直接查看其源码,看起来会比较难受,今天推荐一款在Linux 终端下查看markdown文档的软件mdv,可以实现在终端下直接查看markdown文档,非常方便。一、安装mdv是基于Python的Markdown viewer,安装很简单pip install mdv......

python 批量处理文件

一般涉及到多个文件的处理时,我习惯自己编写脚本来进行处理,像之前我一般习惯使用os库来遍历目录下的文件,相对来说比较麻烦。现在将我知道的一些批量处理的方法总结一下。一、批量获取文件路径1.1、os库这是我之前常用的方法,通过遍历文件夹下所有的文件来进行获取,示例代码如下:import osbase_path = "deal"for root, d......

使用mamba加速conda包安装

Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,在生物信息学上,我们常用来进行软件管理安装等。不过我一直不喜欢用这个,因为安装软件包时,有时候真的太慢了,即使换了国内源还是一样慢,让人难以忍受。最近我发现了一个能加速conda安装的神器-mamba,其能加速conda包的安装,同时使用起来和conda一样。一、安装mamba的github地址为:https://git......

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