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python 批量处理文件

一般涉及到多个文件的处理时,我习惯自己编写脚本来进行处理,像之前我一般习惯使用os库来遍历目录下的文件,相对来说比较麻烦。现在将我知道的一些批量处理的方法总结一下。一、批量获取文件路径1.1、os库这是我之前常用的方法,通过遍历文件夹下所有的文件来进行获取,示例代码如下:import osbase_path = "deal"for root, d......

使用mamba加速conda包安装

Conda 是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,在生物信息学上,我们常用来进行软件管理安装等。不过我一直不喜欢用这个,因为安装软件包时,有时候真的太慢了,即使换了国内源还是一样慢,让人难以忍受。最近我发现了一个能加速conda安装的神器-mamba,其能加速conda包的安装,同时使用起来和conda一样。一、安装mamba的github地址为:https://git......

使用GUI修改ggplot2主题-ggThemeAssist

ggplot2是R常用的画图包之一,但是在主题调整方面需要自己写比较多的代码,同时需要运行才能看到调整后的结果,今天给大家推荐一个用于调整ggplot2主题的R包ggThemeAssist,它在RStudio上提供了一个编辑ggplot2主题的gui页面,可以方便我们调整绘图的主题细节,同时会生成相应的代码。一、安装安装比较简单install.packages("ggT......

引物特异性验证

作为生物dog,相信分子生物学实验做的不少(当然,因为专业原因,我虽然做过,但是很少),而这个往往离不开引物设计,在引物设计完成后,我们如何验证引物的特异性,防止扩增的时候引入杂带呢?下面我将介绍两种方法进行校验,希望能对你有所帮助!一、primer-blastprimer-blast是NCBI平台下的一个引物设计软件,其使用Primer3 设计 PCR 引物,同时使用blast和......

Linux 下使用水星MW150US无线USB网卡

最近买了个水星的无线网卡,打算给家里的linux服务器加上,但是使用ifconfig没有识别到网卡,为了查看是否识别出来该USB网卡,使用如下命令查看lsusb# 输出信息中发现了# 148f:7601 Ralink Technology, Corp. MT7601U Wireless Adapter从上我们可以看出该网卡能成功被识别,说明不能使用是没......

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