Annovar的安装和使用
ANNOVAR 是一种高效的软件工具，可利用最新信息对从不同基因组（包括人类基因组 hg18、hg19、hg38 以及小鼠、蠕虫、果蝇、酵母和许多其他基因组）中检测到的遗传变异进行功能注释。ANNOVAR 可以执行： 基于基因的注释：确定 SNP 或者 CNV 是否会导致蛋白质编码变化和影响氨基酸。用户可以灵活使用RefSeq genes, UCSC genes, ENSEMBL ge......
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基于高通量数据进行HLA分型
一、简介HLA即人类白细胞抗原（human leukocyte antigen），是编码人类的主要组织相容性复合体（MHC）的基因。其位于6号染色体的短臂上（6p21.31），包括一系列紧密连锁的基因座，与人类的免疫系统功能密切相关。其中部分基因编码细胞表面抗原，成为每个人的细胞不可混淆的“特征”，是免疫系统区分自身和异体物质的基础（来源于维基百科）。二、HLAScanHL......
nas 搭建个人书城
个人收集了部分电子书籍，但是一直没有进行整理，手头上又正好有一台组装好的nas，故打算用nas来搭建个人的书库，用于整理和阅读书籍。我使用的平台是calibre-web一、安装我使用docker来管理这些应用，我们可以使用别人做好的镜像来进行搭建，比较方便快捷。github和dockerhub上可以找到其对应的信息。在安装好docker的情况下，直接运行下诉命令来拉取镜像。......
Linux 配置ssh安全登录及登录提醒
SSH一、安装google-authenticatorapt-get install libpam-google-authenticator二、运行google-authenticatorgoogle-authenticator而后在输出信息中根据需求选择Y或者N即可三、配置ssh首先，需要修改/etc/pam.d/sshd文......
Linux终端下阅读Markdown文档
在日常工作中，我们时不时会遇到markdown文档,一般我们都是需要用特定的软件进行打开，在终端上一般都是直接查看其源码，看起来会比较难受，今天推荐一款在Linux 终端下查看markdown文档的软件mdv，可以实现在终端下直接查看markdown文档，非常方便。一、安装mdv是基于Python的Markdown viewer，安装很简单pip install mdv......
