Linux无root,安装R stringi 包出错（ICU69无法下载）
在linux服务器上安装reshape2s时，报错了，最终追踪到是按照依赖包stringi出的错，安装该包时需要用到一个叫icu69的压缩文件，但是直接访问不到，所以导致最终安装失败了（如果可以科学上网的话应该正常安装），所以我们需要手动将其下载下来，同时也需要将stringi包下载下来先。1. icu4c2.stringi下载完成后，到linux终端下运行以下命令进行安装......
分类:计算机
使用git 管理svn 项目
一、前言git和svn都是代码版本控制工具，一般来说都是用的git，但是也不排除有些公司用的是svn，如果个人平时常用git管理，而公司用的是svn进行管理，并且又不想学习svn的用法的话，我们可以直接使用git来管理svn项目。二、git 管理svn项目使用git管理svn项目，需要用到的命令是git svn ，但是在一些Linux版本中，直接使用该命令可能会提示找不到该......
PCR eds文件提取解析
由于项目需要，需要使用PCR的数据，虽然可以从eds文件中导出excel文件，但是相对来说比较麻烦，所以就在寻找一种能直接处理eds文件的方法或者脚本，找了好久都没找到，最后在网上找到了答案，eds文件本身是一个压缩文件，直接将文件后缀修改为zip后，解压缩即可，不过其中的图像文件暂时还没办法解析！ 参考：1. https://github.com/nzxzxw/e......
Snakemake 遇到的问题汇总
这里主要记录一些snakemake使用过程中遇到得问题，不定期更新......
DNA 甲基化测序（Bisulfite-Seq）的比对和检测工具Bismark原理浅析
好久没更新了，最近在弄DNA甲基化测序的东西，接触到了Bismark这个软件，由于对甲基化测序数据的比对有点疑惑，同时文献不长，所以简单看了下，在此做个记录。一、甲基化测序基本原理一般来说，就是将DNA使用重亚硫酸盐处理，使得DNA链中的碱基非甲基化C转为U，而后在PCR流程中转化为碱基A，而甲基化的碱基C不受影响。（更详细的建议自行查找下材料、文献学习）......
