生信之旅

分类:计算机

Linux无root,安装R stringi 包出错(ICU69无法下载)

在linux服务器上安装reshape2s时,报错了,最终追踪到是按照依赖包stringi出的错,安装该包时需要用到一个叫icu69的压缩文件,但是直接访问不到,所以导致最终安装失败了(如果可以科学上网的话应该正常安装),所以我们需要手动将其下载下来,同时也需要将stringi包下载下来先。1. icu4c2.stringi下载完成后,到linux终端下运行以下命令进行安装......

使用git 管理svn 项目

一、前言git和svn都是代码版本控制工具,一般来说都是用的git,但是也不排除有些公司用的是svn,如果个人平时常用git管理,而公司用的是svn进行管理,并且又不想学习svn的用法的话,我们可以直接使用git来管理svn项目。二、git 管理svn项目使用git管理svn项目,需要用到的命令是git svn ,但是在一些Linux版本中,直接使用该命令可能会提示找不到该......

PCR eds文件提取解析

由于项目需要,需要使用PCR的数据,虽然可以从eds文件中导出excel文件,但是相对来说比较麻烦,所以就在寻找一种能直接处理eds文件的方法或者脚本,找了好久都没找到,最后在网上找到了答案,eds文件本身是一个压缩文件,直接将文件后缀修改为zip后,解压缩即可,不过其中的图像文件暂时还没办法解析! 参考:1. https://github.com/nzxzxw/e......

DNA 甲基化测序(Bisulfite-Seq)的比对和检测工具Bismark原理浅析

好久没更新了,最近在弄DNA甲基化测序的东西,接触到了Bismark这个软件,由于对甲基化测序数据的比对有点疑惑,同时文献不长,所以简单看了下,在此做个记录。一、甲基化测序基本原理一般来说,就是将DNA使用重亚硫酸盐处理,使得DNA链中的碱基非甲基化C转为U,而后在PCR流程中转化为碱基A,而甲基化的碱基C不受影响。(更详细的建议自行查找下材料、文献学习)......

公告栏

有任何问题均可以在文章页面留言!或者邮件 burning@burning.net.cn 欢迎关注微信公众号 “生信之旅”,每天均可在菜单栏领取外卖红包、支付宝红包!最高20元!

服务器推荐

欢迎关注公众号

欢迎关注生信之旅