SSH/SFTP通过SSH Tunnel跳板机登录内部服务器
近期在公司服务器（这里简称为A）上下载数据，由于通过网页下载比较麻烦，就想通过sftp来传输数据，但是一开始在A 上找不到对应的数据路径，而后通过查看网页端服务器配置发现了其代理了另一台机器（B），最终发现B是A上开的虚拟机，路径找到了，但是连接却成了问题。我想把数据直接下载到分析服务器（C）上，但是C直接访问不到B。......
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debian11增加开机自启脚本
在低版本的debian系linux系统中，增加开机自启脚本比较简单，直接修改/etc/rc.local文件，在exit 0之前增加需要运行的脚本即可。但是现在在高版本的linux中默认没有开启该功能，接下来我们同个设置来开启该功能。首先，我们到/lib/systemd/system目录下，在该目录下，可以发现有个rc-local.service文件，使用文本编辑器，在最后加上下列信息......
按物种拆分blast本地库
NCBI的nr、nt库包含了基本上所有现有已知物种的序列信息，再进行blast时，由于数据库较大，搜索时间会比较长，同时可能会有其他物种信息干扰。因此我们可以根据NCBI提供的物种分类号对其进行拆分，下面以nr库进行举例说明。一、准备1.1、数据： nr库：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/ accession2......
生物信息常用文件格式（3）- SAM/BAM
bam格式是目前最常见的比对数据存储格式，其是一种高度压缩的格式，sam是其文本格式，下面将与sam格式进行说明。sam格式是一个tab键分隔的文本格式，包含两个部分: header section （可选的） alignment section。其中header 行以‘@’开头，若存在header，则必须在alignment 行之前。alignment 行包含......
生物信息常用文件格式（2）- FASTQ
FASTQ格式是一种保存生物序列（通常为核酸序列）及其测序质量得分信息的文本格式。格式FASTQ文件中，一条序列信息由四行组成。 第一行以@开头，之后为序列的标志符和描述信息； 第二行为序列信息； 第三行以+开头，后面可加上序列标志符，描述信息，也可以不加任何东西； 第四行为第二行每个碱基的质量得分，以单个ASCII字符表示；一个FASTQ例子如......
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