BWT算法浅析-(一)
一、前言BWT算法对数据量大的数据来说，压缩比较有效，目前已经广泛用于生物学数据的存储中，例如bowtie就使用到了这一策略。虽然之前在大学期间学过该算法，但是有点遗忘了，故重新复习一番。二、什么是BWT？严格来说，BWT并不是压缩算法，它仅是把需要压缩的字符重新排列，将相同的字符排在一起或者相邻位置，使其更易被压缩。三、BWT原理BWT算法主要分为两个......
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Blast是我们在分析数据常用的一个软件，功能是序列比对，相信生物类的同学应该多多少少都会用它的网页版不过网页版有其局限性： 上传的序列不能过大 不能使用自己构建的数据库等网页版有一定的局限性，所以说我们需要构建自己本地的Blast环境，下面我就分步骤来说明下Blast本地安装。一、下载Blast安装包到Blast的官网（https://......
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GGPLOT2 设置坐标轴标签颜色
之前在网上看到别人的图的坐标轴的标签有颜色，当时就很好奇这是如何实现，所以后面查了一波资料，并且不断尝试，最终终于让我研究出来了，故在此记录一下，也为了能帮助到需要的人，闲话不多说了，让我们开始吧。一、具体代码library(ggplot2)test_data <-data.frame(x=c("sample1","sample2","sample3",y=c(10,15,......
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