生信之旅

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GWAS分析-EMMAX软件

GWAS的全称是全基因组关联分析(Genome-wide association study),从物种基因组范围内中找出存在的单核苷酸多态性(SNP),与某种表型进行关联分析,从而找出与表型相关的SNPs。进行GWAS分析的软件有很多,今天我们主要使用EMMAX软件,其官网为(http://genetics.cs.ucla.edu/emmax/),该软件使用的是混合模型。下面介绍它的安装及使用:......

LDHEATMAP包的使用

由于文章的需要,需要对LD block进行修改,之前是用HaploView进行绘制的,但是调整不了出图参数,故尝试使用R包LDheatmap重新绘制。 首先是LDheatmap的安装,由于其依赖包 snpStats在Bioconductor  上,故先安装该包,再安装 LDheatmap if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = ......

在UBUNTU16.04下从源码安装GIMP2.8

首先,在gimp的官网上下载最新版的gimp。然后解压缩。在命令行下进入到gimp解压后的目录下,运行./configure命令进行安装。然后发现需要babl >= 0.1.10。所以我到babl官网下载最新的babl进行安装。解压缩后,在命令行进入到babl的解压缩的目录下,分别运行如下命令进行安装。./configuremakesudo make in......

在树莓派3B中基于PYTHON3.5安装OPENCV

在树莓派3B上安装Python3.5可以使用的opencv,首先我的配置如下: 硬件配置:树莓派3B(原装系统) opencv版本:4.0.0-pre 接下来我们安装需要的依赖环境: 编译:sudo apt-get install build-essential 必需:sudo apt-get install cmake git libgtk2.0-dev p......

解决树莓派3B连接蓝牙耳机无声问题

树莓派3B支持蓝牙模块,我们将蓝牙与树莓派连接上之后,打开音乐播放器,却发现没有声音,这时我们要在树莓派系统界面中的喇叭标识符中右击鼠标,选择我们的蓝牙即可。 感谢这位大佬提供的帮助: https://blog.csdn.net/chenbo163/article/details/78467908......

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