git作为常用的版本控制系统# 若未配置用户名和地址则需要先配置先git config --global user.email "you@example.com"git config --global user.name "Your Name"git init # 将当前目录作为git仓库git add readme.md # 添加一个文件到版本库,若comm......
生信软件的安装方式一般分为几种: 1. 使用apt、pip之类的包管理器进行安装(需要掌握管理器命令) 2. 直接下载使用(简单实用) 3. 软件源码编译(需要一定基础和耐心) 对于上诉方法来说,直接下载使用是最方便的方法;其次是使用apt、pip、conda之类的包管理器,也是比较方便的,国内的话建议更换国内源,可以增加下......
上次我们介绍了metaphlan2,其分析完后若需要绘制GraPhlan图,则需要安装GraPhlan,下面我就该软件的安装以及遇到的问题进行记录。一、安装1.1、GraPhlAn的安装GraPhlAn的安装比较简单,可以使用Bioconda、pip或者github源码安装1、Bioconda: conda install -c bioconda graph......
MetaPhlAn2是分析微生物群落组成的一个工具,在分析宏基因组数据时十分有用。......
SOAPdenovo2是用于序列组装的常用软件,其可在GitHub上下载并进行安装,网站为:https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2一、安装使用git下载,使用make进行编译git clone https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2.gitcd SOAPdenovo2......