生信软件安装方式浅谈-随笔
生信软件的安装方式一般分为几种:
1. 使用apt、pip之类的包管理器进行安装(需要掌握管理器命令)
2. 直接下载使用(简单实用)
3. 软件源码编译(需要一定基础和耐心)
对于上诉方法来说,直接下载使用是最方便的方法;其次是使用apt、pip、conda之类的包管理器,也是比较方便的,国内的话建议更换国内源,可以增加下载速度,不过个人不是很喜欢使用conda安装软件,因为有时候总会出现各种问题,完全没有头绪,而且下载也会很慢;我个人比较喜欢的安装方法是直接源码编译,因为你可以选择安装的位置,可定制的程度高,唯一烦的就是可能缺少各种依赖,但是解决这些问题的时候能让我感觉到快乐,也算一种乐趣吧!
反正选择哪种方法看个人习惯,同时也考虑哪种方法能快速解决你的问题吧!
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