生信之旅

标签:Linux

VirtualBox共享文件夹不可用

我想在我windos10上创建一个共享目录与debian10虚拟机进行共享,但是不知道为什么一直挂载不上,使用命令sudo /sbin/mount.vboxsf win_share usb/进行挂载,但是报错/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: No such device找了很久都找不到问题所在......

问题解决记录:anaconda 中的R找不到ldpaths

最近公司的流程跑不通了,相关人员反馈后通过日志信息发现报错信息如下R: 238: .: Can't open xxx/etc/ldpaths直接查看该路径发现确实没有ldpaths,而后直接运行R时发现还是报该错,说明这是R直接出现了问题,而不是某个包,通过查看其他anaconda 环境的R,发现了ldpaths这个文件,查看后,发现该文件主要是设置java环境等环境变量,故我将其......

GraPhlAn的安装

上次我们介绍了metaphlan2,其分析完后若需要绘制GraPhlan图,则需要安装GraPhlan,下面我就该软件的安装以及遇到的问题进行记录。一、安装1.1、GraPhlAn的安装GraPhlAn的安装比较简单,可以使用Bioconda、pip或者github源码安装1、Bioconda: conda install -c bioconda graph......

MetaPhlAn2安装及使用

MetaPhlAn2是分析微生物群落组成的一个工具,在分析宏基因组数据时十分有用。......

SOAPdenovo2的安装使用

SOAPdenovo2是用于序列组装的常用软件,其可在GitHub上下载并进行安装,网站为:https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2一、安装使用git下载,使用make进行编译git clone https://github.com/aquaskyline/SOAPdenovo2.gitcd SOAPdenovo2......

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