生信之旅

标签:Linux

基于BerryBoot安装树莓派多系统

树莓派作为卡片式的小型计算机,用途很广,有大量的系统可用,但是如果一个用途就需要安装一次系统的话,就比较麻烦,所以尝试用BerryBoot来安装多系统。一、BerryBoot安装BerryBoot的安装比较简单,下载好BerryBoot的压缩包后,直接解压到SD卡中,启动树莓派即可。启动成功后,将会有配置网络等信息,将其配置完成后重启即可添加系统。添加BerryBoot自带......

docker安装花生壳实现内网穿透

花生壳是一款内网穿透软件,可实现内网穿透功能,为了实现家庭nas能在公网进行访问,我打算采用docker来进行安装花生壳。故在此记录安装过程和遇到的问题。花生壳官网:https://hsk.oray.com/一、docker容器创建1.1、创建并运行容器直接基于ubuntu启动容器,或者你也可以创建Dockerfile来创建镜像后再运行。docker r......

Annovar的安装和使用

ANNOVAR 是一种高效的软件工具,可利用最新信息对从不同基因组(包括人类基因组 hg18、hg19、hg38 以及小鼠、蠕虫、果蝇、酵母和许多其他基因组)中检测到的遗传变异进行功能注释。ANNOVAR 可以执行: 基于基因的注释:确定 SNP 或者 CNV 是否会导致蛋白质编码变化和影响氨基酸。用户可以灵活使用RefSeq genes, UCSC genes, ENSEMBL ge......

基于高通量数据进行HLA分型

一、简介HLA即人类白细胞抗原(human leukocyte antigen),是编码人类的主要组织相容性复合体(MHC)的基因。其位于6号染色体的短臂上(6p21.31),包括一系列紧密连锁的基因座,与人类的免疫系统功能密切相关。其中部分基因编码细胞表面抗原,成为每个人的细胞不可混淆的“特征”,是免疫系统区分自身和异体物质的基础(来源于维基百科)。二、HLAScanHL......

nas 搭建个人书城

个人收集了部分电子书籍,但是一直没有进行整理,手头上又正好有一台组装好的nas,故打算用nas来搭建个人的书库,用于整理和阅读书籍。我使用的平台是calibre-web一、安装我使用docker来管理这些应用,我们可以使用别人做好的镜像来进行搭建,比较方便快捷。github和dockerhub上可以找到其对应的信息。在安装好docker的情况下,直接运行下诉命令来拉取镜像。......

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