生信之旅

标签:python

在DEBIAN下利用PIP安装SCRAPY(PYTHON3)出错

在最开始的时候我使用命令: pip3 install scrapy --user 来安装到用户目录下的,但是不知道为啥一直报段错误,当时是一脸懵逼的,网上也找不到解答。后来到scrapy官网下载了源代码,利用命令: python3 setup.py install --user 这回倒没有报错了,也import的了,但是再终端中输入scrapy却报找不到该命令,然后一气之下......

在DEBIAN系统上配置VIM来开发PYTHON3

我使用的是debian9,默认安装了Python3.5,但是没有安装vim,所以我使用了APT来安装vim: sudo apt-get install vim-nox 该版本的vim默认支持Python3,所以不用通过源码编译的方法进行配置。 要查看vim是否支持Python3,可以使用命令: vim --version 来查看,如果Python3前面有个+号则表示支......

UBUNTU下PYTHON3安装使用SCRAPY时遇到的一个小问题

在利用pip安装scrapy时是成功的,但是在使用的过程中却有警告: :0: UserWarning: You do not have a working installation of the service_identity module: 'cannot import name 'opentype''. Please install it from and make su......

使用PYTHON3中的MYGENE包来转换基因ID

基因ID之间有时候需要相互转换,下面我介绍一下一个在Python3下的转换基因ID的包mygene 首先,需要安装这个包 pip install mygene 安装成功后即可使用。 import mygene mg = mygene.MyGeneInfo() geneName = ['DDX26B', 'CCDC83', 'MAST3', 'FLOT1'......

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