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使用PYTHON3中的MYGENE包来转换基因ID

基因ID之间有时候需要相互转换,下面我介绍一下一个在Python3下的转换基因ID的包mygene

首先,需要安装这个包
pip install mygene

安装成功后即可使用。

import mygene

mg = mygene.MyGeneInfo()
geneName = ['DDX26B',
 'CCDC83',
 'MAST3',
 'FLOT1',
 'RPL11',
 'ZDHHC20',
 'LUC7L3',
 'SNORD49A',
 'CTSH',
 'ACOT8']
out = mg.querymany(geneName, scopes='symbol', fields='ensembl.gene', species='human')

这只是一个简单的教程,想要详细了解的,去Python3的官网查看该包的使用教程

版权声明:本文转载请注明出处!

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