使用PYTHON3中的MYGENE包来转换基因ID
基因ID之间有时候需要相互转换,下面我介绍一下一个在Python3下的转换基因ID的包mygene
首先,需要安装这个包
pip install mygene
安装成功后即可使用。
import mygene mg = mygene.MyGeneInfo() geneName = ['DDX26B', 'CCDC83', 'MAST3', 'FLOT1', 'RPL11', 'ZDHHC20', 'LUC7L3', 'SNORD49A', 'CTSH', 'ACOT8'] out = mg.querymany(geneName, scopes='symbol', fields='ensembl.gene', species='human')
这只是一个简单的教程,想要详细了解的,去Python3的官网查看该包的使用教程。
版权声明:本文转载请注明出处!
最新评论:
发表评论
电子邮件地址不会被公开。 必填项已用*标注