SSH/SFTP通过SSH Tunnel跳板机登录内部服务器
近期在公司服务器（这里简称为A）上下载数据，由于通过网页下载比较麻烦，就想通过sftp来传输数据，但是一开始在A 上找不到对应的数据路径，而后通过查看网页端服务器配置发现了其代理了另一台机器（B），最终发现B是A上开的虚拟机，路径找到了，但是连接却成了问题。我想把数据直接下载到分析服务器（C）上，但是C直接访问不到B。......
分类:计算机
debian11增加开机自启脚本
在低版本的debian系linux系统中，增加开机自启脚本比较简单，直接修改/etc/rc.local文件，在exit 0之前增加需要运行的脚本即可。但是现在在高版本的linux中默认没有开启该功能，接下来我们同个设置来开启该功能。首先，我们到/lib/systemd/system目录下，在该目录下，可以发现有个rc-local.service文件，使用文本编辑器，在最后加上下列信息......
生物信息常用文件格式（3）- SAM/BAM
bam格式是目前最常见的比对数据存储格式，其是一种高度压缩的格式，sam是其文本格式，下面将与sam格式进行说明。sam格式是一个tab键分隔的文本格式，包含两个部分: header section （可选的） alignment section。其中header 行以‘@’开头，若存在header，则必须在alignment 行之前。alignment 行包含......
序列比对-动态规划算法
在研究生物学功能的时候，一般同源性序列意味着相似性，虽然序列相似不一定可以说明序列同源，但是相似度高的序列很有可能也是同源的，这一假设对研究基因和蛋白质很有帮助。一对残基间可能的比对只有三种， 序列X的碱基A比对到序列Y的碱基B; 序列X的碱基A比对到序列Y的空位; 序列X的空位比对到序列Y的碱基B；下面基于此介绍一下比对的方法。序列X: AAG序列Y:......
蛋白互作网络分析（PPI）
蛋白质互作网络分析对了解蛋白质功能、关系有重要意义。一般来说，现在分析蛋白质互作网络使用的是string在线数据库进行分析，而后再使用cytoscape对网络进行下一步的分析或修整。一、string数据库的使用官网：https://www.string-db.org/打开官网，点击Multiple Proteins ，在输入框中输入差异表达基因名，一行一个，选择好物种后，点......
